口袋妖怪之破碎的梦

三年前，神秘组织火箭队给关东联盟造成了灾难，这个组织的目的已经昭然若揭：利用强大的口袋妖怪来征服全世界。火箭队的老大，利用各种资源制作出强大的口袋妖怪超梦，来实现自己的野心。幸好，在他的邪恶计划实现之前，被一名叫做小智的年轻训练员打败了。最后坂木老大被逮捕了，并且超梦也从他身上没收了，为了确保火箭队永远无法利用超梦的力量作恶，超梦的力量被封印在传说中的口袋妖怪吉拉奇身体里面，并且吉拉奇陷入了永远的沉睡。。。3年后，你是一名住在申奥地区的某个城镇中的少年/少女训练员，你的好友Ace/Ariel(根据性别而决定)从来自关东地区的大木博士手上得到口袋妖怪，你将和历代主角一样接受大木博士的委托，为了完成口袋图鉴而展开冒险的旅程，一路上你将会遇到口袋妖怪猎人以及企图捕捉吉拉奇来释放超梦力量的火箭队残部，为何火箭队会回归？为何火箭队会在申奥出现？火箭队又是利用了什么力量袭击了城都以及申奥？更多的请在游戏中体会吧！